W czerwcu 1943 r. w Iwieńcu wybuchł opór przeciw hitlerowskim najeźdźcom, a później zbrojny oddział niemiecki pojawił się w Pierszajach. OO. Herman i Achilles byli ostrzeżeni przez komendanta żandarmerii o zbliżających się do wioski wojskach.
Mogli się uratować, jednak chcieli do końca dzielić los swoich parafian; o. Herman miał powiedzieć: „gdzie są owce, tam i ich pasterz". 19 lipca 1943 r. Franciszkanie zostali zatrzymani, torturowani, a potem rozstrzelani i spaleni na skraju wioski Borowikowszczyzna. O. Herman miał wówczas 33 lata, o. Achilles był o rok młodszy.
Po zamordowaniu kapłanów, hitlerowcy oszczędzili pozostałych zatrzymanych i wysłali ich na przymusowe roboty do Niemiec.
O. Herman Stępień i o. Achilles Puchała należą do grona 108 męczenników Kościoła w Polsce z okresu II wojny światowej, beatyfikowani przez Jana Pawła II 13 czerwca 1999 r. w Warszawie.